Digital, DICOM, diagnostics—unity over chaos: Data communication in digital pathology

TL;DR

Digital pathology faces challenges due to lack of standards, but the DICOM format offers a solution for interoperable data exchange.

Contribution

A modular, open-source Docker pipeline demonstrates DICOM-compliant workflows for digital pathology.

Findings

DICOM is increasingly recognized as a key format for digital pathology.

A Docker-based pipeline enables standardized storage and visualization of whole slide images and AI results.

Interoperability between proprietary systems and clinical workflows is achievable with DICOM.

Abstract

Die Digitalisierung histologischer Schnitte eröffnet neue Potenziale für die KI-gestützte Diagnostik, wird jedoch durch fehlende Standards behindert. Besonders die Interoperabilität zwischen proprietären Formaten, Algorithmen und klinischen Systemen wie PACS oder LIS stellt eine zentrale Herausforderung dar. Das interdisziplinäre DICOM-Format bietet hierfür eine offene, herstellerunabhängige Lösung, die Bilddaten, Metadaten und Analyseergebnisse integriert und interoperablen Austausch ermöglicht. Eine durchgeführte Literaturrecherche zeigt eine wachsende Zahl an Publikationen zur digitalen und computergestützten Pathologie, wobei DICOM zunehmend als Schlüsselformat diskutiert wird. Mit einer quelloffenen, modularen Docker-Pipeline demonstrieren wir die praktische Umsetzung DICOM-konformer Workflows zur Speicherung und Visualisierung von „whole slide images“ und KI-Ergebnissen. Damit wird die Basis für standardisierte, transparente und vertrauenswürdige digitale Pathologie geschaffen.

Figures