# A case of 46,XX testicular disorders of sex development due to an apparent synonymous variant in the <i>WT1</i> gene: difficulties of differential diagnosis of intrauterine virililzation syndrome in a girl

**Authors:** А. А. Буянова, И. Г. Воронцова, А. Ф. Самитова, Ю. А. Василиадис, Е. Е. Петряйкина, Е. С. Демина, А. Н. Тюльпаков

PMC · DOI: 10.14341/probl13436 · Problems of Endocrinology · 2024-04-02

## TL;DR

A rare case of 46,XX testicular disorder of sex development is described, caused by a variant in the WT1 gene, highlighting diagnostic challenges in intrauterine virilization syndrome.

## Contribution

The study presents a novel case of 46,XX testicular disorder of sex development caused by a WT1 gene variant that affects splicing despite not altering the amino acid sequence.

## Key findings

- A de novo synonymous variant in the WT1 gene was found to disrupt splicing and cause a 46,XX testicular disorder of sex development.
- The patient was initially misdiagnosed with intrauterine virilization syndrome before the correct diagnosis was confirmed.
- The case illustrates the diagnostic difficulties in distinguishing between intrauterine virilization and 46,XX testicular disorders.

## Abstract

Термин нарушения формирования пола (НФП) объединяет группу врожденных состояний, при которых имеет место несоответствие между хромосомным и (или) гонадным полом и строением половых органов. К одной из групп НФП относятся тестикулярные нарушения при кариотипе 46,XX (ТНФП_46,XX), в структуре которой выделяют формы, обусловленные транслокацией гена SRY, и более редко — SRY-негативные формы. В настоящем сообщении нами представлено наблюдение пациента с SRY-негативным ТНФП_46,XX, у которого первоначально состояние расценивалось как вирильная форма врожденной дисфункции коры надпочечников (ВДКН), затем — как идиопатическая внутриутробная вирилизация у девочки. На фоне вирилизации в возрасте 11 лет было заподозрено наличие тестикулярной ткани. При молекулярно-генетическом обследовании (полноэкзомное секвенирование с валидацией методом С энгера) был обнаружен de novo вариант в экзоне 9 гена WT1 (chr11:32413528T>C), который по предсказаниям не приводил к изменению аминокислотной последовательности (p.Thr479=, NM_024426.6), однако нарушал сплайсинг, результатом чего было характерное для ТНФП_46,XX изменение C-концевого домена WT1. После верификации диагноза проведена гонадэктомия и назначена заместительная терапия эстрогенами. Таким образом, нами описан пациент с редкой формой ТНФП_46,XX, обусловленного вариантом в гене WT1. Представленное наблюдение иллюстрирует сложности дифференциальной диагностики синдрома внутриутробной вирилизации при женском кариотипе.

## Linked entities

- **Genes:** WT1 (WT1 transcription factor) [NCBI Gene 7490]

## Full-text entities

- **Genes:** SRY (sex determining region Y) [NCBI Gene 6736] {aka SRXX1, SRXY1, TDF, TDY}, WT1 (WT1 transcription factor) [NCBI Gene 7490] {aka AWT1, GUD, NPHS4, WAGR, WIT-2, WT-1}
- **Diseases:** DSD (MESH:D012734), 46,XX TDSD (MESH:D058531), congenital adrenal hyperplasia (MESH:D000312), intrauterine virilization syndrome (MESH:D014770), intrauterine virililzation syndrome (MESH:D005317)
- **Species:** Homo sapiens (human, species) [taxon 9606]
- **Mutations:** 32413528T>C, p.Thr479=

## Full text

_Full body text omitted from this summary view._ Fetch the complete paper as Markdown: https://tomesphere.com/paper/PMC11931460/full.md

## Figures

1 figure with captions in the complete paper: https://tomesphere.com/paper/PMC11931460/full.md

## References

18 references — full list in the complete paper: https://tomesphere.com/paper/PMC11931460/full.md

---
Source: https://tomesphere.com/paper/PMC11931460