Are omicron infections more frequently associated with bacterial co-infections?

TL;DR

This study compares clinical and radiographic features of Omicron versus alpha-delta COVID-19 infections, finding that Omicron may be linked to more bacterial co-infections.

Contribution

The paper provides new clinical data comparing Omicron and alpha-delta infections, suggesting higher bacterial co-infection rates with Omicron.

Findings

Omicron infections showed higher consolidation rates and procalcitonin levels, suggesting bacterial co-infections.

Omicron patients had lower LDH levels and less need for intensive care compared to alpha-delta cases.

Procalcitonin levels were elevated in 43.9% of Omicron patients, indicating possible bacterial involvement.

Abstract

ABSTRACT

Are omicron infections more frequently associated with
bacterial co-infections?

Introduction:

Clinical observations suggest
that Omicron infections may pre- sent with different radiographic
findings and be more frequently associated with bacterial
co-infections, but there is a paucity of published data. This study
aimed to compare the clinical and radiographic findings of patients
hospitalized with Omicron versus alpha-delta
infections.

Materials and Methods:

Between January 1,
2021 and June 30, 2021 (alpha

and delta period) and between January 1, 2022 and July
31, 2022 (Omicron period), respectively 149 and 163 COVID-19
PCR-positive patients who were followed up in the COVID-19 ward and
intensive care unit of a tertiary care center were included in the
study. Clinical (presence of fever and purulent sputum), laboratory
and radiologic findings of the two groups were com- pared. Sputum
culture results and antibiotic use were also evaluated.

Results:

In the alpha/delta group, ground
glass opacities were seen in 75.2%

(112) of the patients, consolidation in 2.7% (4), and
both findings together in 6.0% (9). In the Omicron group, ground
glass was seen in 40.5% (66), con- solidation in 5.5% (9), and both
ground glass and consolidation together in 8.7% (13) (p< 0.001).
Procalcitonin levels were 0.25 µg/L or higher in 29.6% and 43.9% of
the patients in the alpha/delta and Omicron groups, respec- tively.
Mean PCT values were 0.36 µg/L and 1.93 µg/L, respectively (p>
0.05). CRP levels were similar in both groups. Mean LDH level in the
Omicron group was 278 U/L and was significantly lower than the
alpha/delta group (381 U/L) (p< 0.001). The proportion of
patients requiring intensive care during hospitalization was higher
in the alpha/delta group (36.2% vs 26.4%) (p= 0.06).

Conclusion:

Lower LDH levels, less need for
intensive care and less frequent development of ARDS indicate that
Omicron causes milder disease, while a higher rate of consolidation
and higher procalcitonin levels suggest a higher frequency of
bacterial co-infections.

Key words:

COVID-19; SARS-CoV-2;
co-infections

ÖZ

Omicron enfeksiyonlarında bakteriyel koenfeksiyon riski
daha yüksek mi?

Giriş:

Klinik gözlemler, Omicron
enfeksiyonlarının farklı radyografik bulgularla ortaya
çıkabileceğini ve bakteriyel koenfeksiyonlarla daha sık ilişkili
olabileceğini düşündürmektedir, ancak yayımlanmış veri azdır. Bu
çalışmanın amacı, Omicron ve alfa-delta enfeksiyon- ları ile
hastaneye yatırılan hastaların klinik ve radyografik bulgularını
karşılaştırmaktır.

Materyal ve Metod:

1 Ocak 2021-30 Haziran
2021 tarihleri arasında (alfa ve delta dönemi) ve 1 Ocak 2022-31
Temmuz 2022 tarihleri arasında (Omicron dönemi) üçüncü basamak bir
merkezin COVID-19 servisinde ve yoğun bakım ünitesinde takip edilen
149 ve 163 COVID-19 PCR-pozitif hasta çalışmaya dahil edilmiştir.
İki grubun klinik (ateş ve pürülan balgam varlığı), laboratuvar ve
rad- yolojik bulguları karşılaştırılmıştır. Balgam kültürü sonuçları
ve antibiyotik kullanımı da değerlendirilmiştir.

Bulgular:

Alfa/delta grubunda hastaların
%75,2 (112)’sinde buzlu cam opasiteleri, %2,7 (4)’sinde
konsolidasyon ve %6,0 (9)’sında her iki bulgu birlikte görülmüştür.
Omicron grubunda ise %40,5 (66)’inde buzlu cam, %5,5 (9)’inde
konsolidasyon ve %8,7 (13)’sinde hem buzlu cam hem de konsolidasyon
birlikte görüldü (p< 0,001). Prokalsitonin düzeyleri alfa/delta
ve Omicron grupla- rında hastaların %29,6 ve %43,9’unda 0,25 µg/L
veya üzerindeydi. İki gruptaki ortalama PCT değerleri sırasıyla 0,36
µg/L ve 1,93 µg/L idi (p> 0.05). CRP değerleri iki grupta da
benzer düzeydeydi. Ortalama LDH düzeyi Omicron grubunda 278 U/L idi
ve alfa/ delta grubuna (381 U/L) göre daha düşüktü (p< 0,001).
Yoğun bakım gerektiren hasta oranı alfa/delta grubunda daha yüksekti
(%36,2 vs 26,4) (p= 0,06).

Sonuç:

Daha düşük LDH seviyeleri, daha az
yoğun bakım ünitesi ihtiyacı ve daha az ARDS gelişimi Omicron’un
daha hafif hastalığa neden olduğunu gösterirken, daha yüksek
konsolidasyon oranı ve daha yüksek prokalsitonin seviyeleri daha
yüksek bakteriyel koen- feksiyon sıklığına işaret
etmektedir.

Anahtar kelimeler:

COVID-19; SARS-CoV-2;
bakteriyel koenfeksiyon